No ano de 1999, apenas alguns lutadores foram participar do torneio, o resto desapareceu por razões desconhecidas. No torneio, as equipes serão de quatro pessoas, e nesse ano, vieram seis equipes que são:
* Flames team: Kyo Kusanagi, Iori Yagami, Ash Crimson e Chris (Se juntaram para descobrir a causa do ocorrido).
* Fatal team: Terry Bogard, Ryo Sakazaki, Athena Asamiya e Leona Heidern (Se juntaram para participar do torneio).
* Maximum Impact team: Alba Meira, Soiree Meira (Convidados), Gaara (Entrou para investigar Naruto Uzumaki) e Benimaru Nikaido (Convidado).
* New Faces team: Yashiro Nanakase, Shermie (Convidados), Oswald e Ryuji Yamazaki (Se juntaram para ir atrás das Dragon Pills).
* Female team: Mai Shiranui, Yuri Sakazaki, Elisabeth Blanctorche e Chun Li (Convidadas).
Depois de lutas e batalhas, a equípe de Konoha vence esse torneio!
Mas ainda não acabou, apareceram duas pessoas mandadas pela N.E.S.T.S. para acabar com eles, uma não tinha nome(Nameless) e a outra era uma garota chamada Angel. Os dois desafiaram a equipe vencedora a uma batalha, e o Naruto, como sempre imprevisível, aceita o desafio. Eles começaram a lutar, a luta durou muito tempo, até que a equipe derrotou os dois. Angel ficou gravemente ferida, e Nameless, quando estava prestes a morrer, disse:
- Aqueles que faltaram esse ano... eles... morreram!
A equipe fica indignada com as palavras e queriam explicações, daí apareceu um garoto, um garoto que todos conheciam. Shingo Yabuki desafiou a equipe vencedora para uma luta., terminando na sua derrota.
Ele gostou da luta, achou muito legal. Mas de repente, ele sentiu algo estranho. Ele cuspiu muito sangue, sua pele começou à escurecer junto com sua roupa, seus olhos ficaram vermelhos e sua voz mudou. Era Kusanagi, que entrou em seu corpo com o objetivo de acabar com todos do torneio.
O grupo ficou desesperado, menos Naruto, que no lugar de desespero, tinha raiva. Ele queria salvar aquela pobre alma que foi tomada pela maldade. Assim ele se lembrou do cordão dado por uma senhora desconhecida, assim, ele não pensou duas vezes e tentou colocá-lo sobre o pescoço de Kusanagi, mas não conseguiu. Daí apareceu um vulto que pegou o cordão e imediatamente colocou sobre Kusanagi, que rapidamente, saiu do corpo de Shingo.
Aquele vulto era de K', que sobreviveu à catástrofe do tempo, Whip chegou dando lhe um abraço e Maxima ficou muito feliz por ele estar vivo. Mas K' estanhou o Naruto porquê era muito parecido com ele. A missão de Naruto era destruir K', mas de repente apareceu um garoto, era K9999, parece que ele ressuscitou, mas não, ele tinha sido construído dois anos depois, mas também sofreu a tragédia. Ele falou à Naruto toda história da máquina do tempo, mas ele não quis acreditar, Maxima e Whip abandonaram o grupo e forma embora, Naruto queria vingança, assim, ele e Sakura começaram a lutar contra K' e K9999.
